Малкова Елена Сергеевна родилась в Юрьевецком муниципальном районе Ивановской области. 
В 2005 году с отличием окончила Александровский промышленно-гуманитарный техникум по специальности «Бухгалтерский учет и контроль по отраслям».
В 2010 году с отличием завершила обучение в Российском торгово-экономическом университете по специальности «Экономика и управление на предприятии». 
С 2010 по 2014 годы работала в Департаменте экономического развития и торговли Ивановской области.
С начала 2015 года работала в Департаменте энергетики и тарифов Ивановской области. 
С августа 2015 года по ноябрь 2016 года занимала должность начальника управления координации Комплекса развития инфраструктуры Ивановской области. 
С ноября 2016 года - управляющий делами Главы города Иванова, начальник управления делами Главы города Иванова.
С 10 мая 2017 г. назначена на должность руководителя аппарата Администрации города Иванова. 
С 21 января 2019 года назначена на должность Заместителя главы Администрации города Иванова.
С 1 января 2022 года занимает должность Первого заместителя главы Администрации города Иванова.

Организует и координирует работу по:
формированию основных направлений налоговой и бюджетной политики города Иванова,
осуществлению бюджетного процесса в городе Иванове,
осуществлению внутреннего финансового контроля,
осуществлению финансовой деятельности Администрации города Иванова,
вопросам муниципальной службы и реализации кадровой политики.

Координирует деятельность по:
правовому обеспечению деятельности Главы города Иванова и Администрации города Иванова,
контролю исполнения действующего законодательства в деятельности Администрации города Иванова,
подготовке и выпуску правовых актов Администрации города Иванова,
контролю исполнения документов и поручений Главы города Иванова,
работе с обращениями юридических и физических лиц,
работе с архивными документами,
вопросам организационной работы,
вопросам реализации наградной политики,
планированию и осуществлению Администрацией города Иванова закупок товаров, работ, услуг для обеспечения муниципальных нужд заказчика в соответствии с Федеральным законом от 05.04.2013 № 44-ФЗ «О контрактной системе в сфере закупок товаров, работ, услуг для обеспечения государственных и муниципальных нужд».

Осуществляет непосредственный контроль за деятельностью:
руководителя аппарата,
финансово-казначейского управления,
управления бюджетного учета и отчетности,
управления муниципальной службы и кадров,
муниципального казенного учреждения «Управление делами Администрации города Иванова»,

Курирует работу по взаимодействию с:
кредитными организациями на территории города Иванова,
инспекцией Федеральной налоговой службы по городу Иваново,
управлением федерального казначейства по Ивановской области,
органами государственного финансового контроля,
осуществляет координацию взаимодействия по курируемым вопросам с Ивановской городской Думой, Общественным советом города Иванова.

Руководит:
комиссией по бюджетным проектировкам на очередной финансовый и плановый период,
комиссией по реализации вопросов о некоторых социальных гарантиях лицам, замещавшим выборные муниципальные должности на постоянной основе, муниципальные должности муниципальной службы города Иванова и должности членов Избирательной комиссии города Иванова на постоянной (штатной) основе,
комиссией по установлению стажа муниципальной службы и определению размера выплаты надбавок за выслугу лет муниципальным служащим Администрации города Иванова,
комиссией по проведению служебной проверки.